Hey! C'est  Aarón

Membre du groupe de travail DATA du programme Grand Défi Ferments du Futur (FdF).

Je conduit mes activités au sein de la plateforme de bio-informatique MIGALE . Avec une forte collaboration avec autres développeurs, je contribue à la construction d’un Système d’Information capable de structurer les données multi-omiques générées dans le cadre du programme FdF. Les données doivent respecter les directrices FAIR: trouvable (pour Findable), Accessible, Interopérable et Réutilisable.

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Chargé du développement, de la maintenance et l’évolution du site intranet applicatif du Laboratoire Interdisciplinaire des Sciences du Numérique (LISN - Université Paris-Saclay). Le site intranet a été développé avec le stack technique Django, MySQL, Bootstrap et Javascript. Les principales fonctionnalités sont :

> Le système de recrutement des futures membres.
> L’annuaire institutionnel contenant plus de 450 membres actifs
> Le système de gestion du profil pour chaque membre de l’institut (gestion des données personnelles et paramétrage des données publiques).
> Les endpoints de l’API-REST pour alimenter le site publique du laboratoire.
> Le module inventaire pour la gestion du matériel informatique et le suivi des commandes.

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Expérience au sein d'une plateforme technologique où j'ai effectué:

> Des analyses protéomiques avec R et Python à haut débit à partir des échantillons de levures, pour le projet Européen CHASSY, et à partir d'autres sources biologiques (l’humain, des pathogènes des plantes, des bactéries et des mammifères).
> L'utilisation de l'outil GIT pour avoir la traçabilité demandée par la norme de qualité ISO 9001:2015.
> Le déroulement des pratiques de laboratoire des étudiants de Licence Pro.
> Le développement d'un paquet R pour l'analyse de données metaprotéomiques dans le cadre du projet POC Microbiome Rapid-Access.

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Travaux de recherche sur l'étude comparative de deux bactéries du genre Streptomyces ayant des phénotypes différents pour produire soit des antibiotiques soit des lipides. J’étais impliqué dans :

> L’implémentation d’une approche intégrative en combinant des méthodes biochimiques et statistiques pour identifier les protéines responsables des différents phénotypes.
> L’optimisation de l’ensemble du processus (partie expérimentale et partie informatique avec des scripts en langage R) pour mener la fouille des données protéomiques à haute débit.
> Valorisation de la recherche par des présentations dans des congrès à l’international et par des publications des articles scientifiques.
> Développement des compétences en gestion de projet pour atteindre les objectifs dans les délais stipulés et dans un environnement multidisciplinaire.

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Travaux de recherche effectués à l’Unité Professionnelle Interdisciplinaire de Biotechnologie (UPIBI-IPN), où j’ai:

> Réalisé l’optimisation des conditions des cultures de microalgues en utilisant la méthode des surfaces de résponses pour booster la production de lipides envisagés comme source de biocarburants.
> Effectué la mise en échelle des cultures d'une microalgue marine du laboratoire (1 l) au niveaux pilot (200 l).
> Présenté les résultats obtenus auprès des conférences en Amérique du Nord.

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